Bu maddede, Atlético Madrid'in 2012-13 sezonunda mücadele ettiği La Liga, Copa del Rey, UEFA Avrupa Ligi ve UEFA Süper Kupası'ndaki maçları, kadro bilgileri ve istatistikleri yer almaktadır. Önceki sezonu ligde 5. sırada tamamlayan ve UEFA Avrupa Ligi'nde şampiyonluğa ulaşan Atlético Madrid, bu sezonu da Arjantinli Diego Simeone'nin teknik direktörlüğünde geçirdi.Takım, sezona Chelsea karşısında alınan 4-1'lik galibiyetin ardından kazanılan UEFA Süper Kupası ile başladı. La Liga'ya ise deplasmanda aldığı 1-1'lik Levante beraberliğiyle başlarken, 9. haftaya kadar oynadığı tüm maçlarını kazandı. 10. haftada Valencia'ya 2-0 yenildi ve ligdeki ilk mağlubiyetini aldı. Oynadığı 38 maçta aldığı 23 galibiyet, 7 beraberlik ve 8 yenilgiyle 76 puan toplamayı başaran takım, ligi 3. sırada tamamladı.Önceki sezonu beşinci sırada tamamlamasından ötürü 2012-13 sezonunda UEFA Avrupa Ligi'nde mücadele etmeye hak kazanan Atlético Madrid, turnuvaya grup aşamasından katıldı. Grubunu ikinci sırada tamamlayıp gruptan çıkmayı başarsa da ikinci turda, Rus ekibi Rubin Kazan'la oynadığı maçlar sonunda kupadan elendi. Copa del Rey'e ise son 32 turundan katılan Atlético Madrid, normal süresi 1-1 biten final maçında Real Madrid'i uzatmalarda attığı golle 2-1 yendi ve kupa tarihindeki 10. şampiyonluğunu yaşadı.